儿童和青少年哮喘患者鼻腔上皮基因表达和总IgE

时间：2024年03月11日

背景:对儿童青少年鼻腔上皮基因表达和总IgE的了解甚少。

目的:该研究旨在鉴定青少年鼻腔上皮细胞表达随总IgE变化的基因，并将其分组成可定位气道上皮细胞类型的模块。

方法:对469例参加波多黎各人表观遗传变异和儿童哮喘研究的9至20岁波多黎各人的总IgE进行了全转录组关联研究，分别在所有受试者和哮喘患者中进行。然后，我们尝试使用来自3个队列的数据来重复每个分析的主要发现。在表观遗传变异与波多黎各儿童哮喘的研究中，带有Benjamini – Hochberg校正P值< 0.05，以及在1个或多个重复队列中相同关联方向的P值小于0.05被认为是差异表达基因(DEGs)。使用共表达分析将哮喘患者总IgE的DEG进一步分解为基因模块，并使用公共单细胞RNA数据将这些模块映射到气道上皮的特定细胞类型。

结果:哮喘患者中总IgE的DEGs数(共 1179个DEGs)高于所有受试者(共631个DEG)。在哮喘患者中，DEG被定位到11个基因模块。与总IgE正相关的顶部模块映射到下气道上皮的肌上皮细胞和粘液分泌细胞，并受IL-4、IL - 5、IL13、IL-33的调节。IL-13和IL-33。在这个模块中，包括中枢基因CDH26、FETUB、NTRK2、CCBL1、CST1、CST2。此外，富集分析显示，基因在以下信号通路中具有过度代表性：突触发生，IL-13和铁死亡，支持白细胞介素和乙酰胆碱诱导反应之间的相互作用。

结论：此研究在鼻腔上皮基因表达方面的发现支持了青少年哮喘患者总IgE的神经免疫协同调节。

点评：本研究利用组学技术，在对患有和不患有哮喘的青少年的鼻上皮进行的全转录组学研究中，发现哮喘患者总IgE的差异表达基因（DEGs）数量(n=1179)高于所有受试者(n=502)，不难理解，这可能是因为哮喘儿童和青少年的总IgE有更大调节范围。该研究同样发现，青少年哮喘患者鼻上皮抗原呈递、T2炎症和IL-4/IL-13信号相关基因的表达与总IgE相关。与总IgE相关性最高的模块内的富集分析支持总IgE的神经免疫协同调节。

参考文献：Zhongli Xu, Erick Forno, Yidan Sun et al, Nasal epithelial gene expression and total IgE in children and adolescents with asthma. J Allergy Clin Immunol 202;153(1):122-131 doi:10.1016/j.jaci.2023.09.014. IF: 14.2